وقد حدث عنه أبوه يونس بن أبي إسحاق، ومات أبوه قبل ابن عرفة بأكثر من مائة عام. وثقه أحمد، وأبو حاتم، والنسائي، وابن خراش، وطائفة.
قال أحمد بن حنبل: هو أصح حديثا من أبيه. قيل له: فإسرائيل؟ قال: ما أقربهما. وقال المروذي، عن أحمد: ثبت. وكنا نخبر أنه سنة في الغزو، وسنة في الحج. وقد قدم بغداد في شيء من أمر الحصون، فأمر له بمال، فأبى أن يقبله.
الأثرم، عن أحمد قال: كان عيسى بن يونس يسند حديث عائشة: أن النبي -ﷺ- كان يقبل الهدية، [ويثيب عليها] والناس يرسلونه، وكذا قال ابن معين.
قال عثمان بن سعيد: سألت يحيى بن معين، قلت: فعيسى بن يونس أحب إليك أو أبو معاوية؟ فقال: ثقة وثقة. وقال حرب بن إسماعيل: سئل علي ابن المديني عن عيسى بن يونس، فقال: بخ بخ، ثقة، مأمون.
وقال ابن عمار: هو أثبت من إسرائيل، عيسى حجة. وقال العجلي: ثقة ثبت يسكن الثغر.
وقيل: إنه زار ابن عيينة، فقال: مرحبا بالفقيه ابن الفقيه ابن الفقيه. وقال أبو زرعة: كان حافظا.
وقال أبو همام السكوني: حدثنا عيسى بن يونس الثقة الرضي. وقال ابن راهويه: قلت لوكيع: إني أريد أن أذهب إلى عيسى بن يونس، قال: تأتي رجلا قد قهر العلم.
أعلام / ٢٤٠٩