عكف الجلدكي على التأليف فأنتج كثيرا من الكتب العلمية التي صارت متداولة في جميع مكتبات العالم، والجدير بالذكر أن معظمها لا يزال على شكل مخطوط في تلك المكتبات.
ذكر جورج سارتون في كتابه (المدخل إلى تاريخ العلوم) المؤلفات الخاصة في حقل الكيمياء وهي: ١ - البدر المنير في معرفة الإكسير.
٢ - بغية الخبير في قانون طلب الإكسير.
٣ - البرهان في أسرار علم الميزان.
٤ - الدر المنثور.
٥ - الدر المكنون في شارح قصيدة الظنون.
٦ - غاية السرور.
٧ - درة الغواص وكنز الاختصاص في معرفة الخواص.
٨ - كشف الستور.
٩ - المصباح في علم المفتاح.
١٠ - مخمس الماء الورقي.
١١ - نتائج الفكر في أحوال الحجر.
١٢ - نهاية الطلب في شرح المكتسب وزراعة الذهب.
١٣ - شرح قصيدة أبي الأصباع.
١٤ - شارح الشمس الكبرى لأبولونيوس.
١٥ - التقريب في أسرار تركيب الكيمياء.
١٦ - أنوار الدر في إيضاح الحجر.
١٧ - كنز الاختصاص في معرفة الخواص.
٦ / ٢٢٢