ومن مؤلفاته الكثيرة النافعة:
١- كتاب السنن وهو مطبوع.
٢- كتاب العلل الذي نوه به الذهبي وابن كثير في كلامهما المتقدم.
٣- كتاب أحاديث الموطأ وذكر اتفاق الرواة عن مالك واختلافهم وزيادتهم ونقصهم وهو مطبوع. وهو أيضا مخطوط في المكتبة الظاهيرية بدمشق ورقمه ٥٢٥ حديث.
٤- كتاب الضعفاء والمتروكين، وهو من مخطوطات الظاهرية بدمشق في المجموع رقم ١٢٤.
٥- أخبار عمرو بن عبيد المعتزلي وكلامه في القرآن وإظهار بدعته، وهو من مخطوطات الظاهرية بدمشق في المجموع رقم ١٠٦.
٦- كتاب المؤتلف والمختلف يوجد منه الجزء الثاني في معهد المخطوطات بجامعة الدول العربية بالقاهرة تحت رقم ٨٤٣ فهرس التاريخ.
٧- رجال البخاري ومسلم يوجد مخطوطًا في الآصفية بجيد أباد وصورته في معهد المخطوطات بالقاهرة رقم ١٠٦٢ فهرس التاريخ.
٨- كتاب الأفراد يوجد بعضه مخطوطًا في ظاهرية دمشق في المجموع رقم ٣٥ و٥٦.
٩- كتاب في التصحيف، قال عنه أبو عمرو بن الصلاح في علوم الحديث ص ٢٥٢: «هذا فن جليل إنما ينهض بأعبائه الحذاق من الحفاظ والدارقطني منهم وله فيه تصنيف مفيد».
١٠- كتاب في الذين رووا عن الشافعي الحديث، قال أبو إسحاق الشيرازي في كتابه طبقات الفقهاء ص١٠٤: «وأما من روى عنه الحديث فخلق كثير ذكرهم الدارقطني في جزءين».
١١- كتاب الاستدراك على الصحيحين.
وفاته:
٨ / ٣٥٣