ثم نُقلت مدرسة أبي بن كعب لتحفيظ القرآن الكريم إلى (بضاعة) وأصبحت في مقرها هذا تضم المراحل الثلاث الابتدائية والمتوسطة والثانوية. ثم إلى مبنى مستأجر في الحرة الشرقية، ثم إلى مبنى آخر في طريق المطار النازل جوار مؤسسة النقد العربي السعودي.
ولما زاد عدد الطلاب في كل مرحلة، تم فصل المرحلة الابتدائية ونقلت إلى مقر وقف المدرسة الكشميرية بحي النصر وذلك في عام ١٤٠٨هـ. وفي عام ١٤١٣هـ نُقلت إلى مبناها الحكومي الحالي الواقع على طريق عثمان بن عفان رضي الله عنه (العيون سابقًا) بحي النصر.
كان الشيخ أحمد ياسين الخياري أول مدير لها وقد استمر حتى عام ١٣٨٠هـ خلفه عدد من المشايخ والأساتذة التربويين الذي بذلوا جهودًا موفقة في سبيل تحقيق أهدافها السامية، فارتقوا بها في درجات السمو والرفعة حتى وصلت إلى المستوى الذي يليق بمكانتها، وأضحت اليوم صرحًا من صروح العلم والمعرفة التي تُعنى بكتاب الله الكريم في هذه البلاد.
٥ - المدرسة السعودية الابتدائية بقباء:
٤٠ / ٢٩٦